Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms