Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Med13Q5SWW4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms