Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms