Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms