Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlha9Q5RJB0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms