Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms