Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms