Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms