Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chsy3Q5DTK1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms