Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urb1Q571H0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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