Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms