Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms