Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm527Q4KL13 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm527Q4KL13 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm527Q4KL13 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm527Q4KL13 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm527Q4KL13 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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