Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms