Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carmil2Q3V3V9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms