Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms