Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms