Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd53Q3V0J4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms