Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms