Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY34

Uncharacterized protein C12orf43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UY34 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UY34 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UY34 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UY34 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UY34 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UY34 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UY34 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UY34 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UY34 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UY34 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UY34 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UY34 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UY34 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UY34 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UY34 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UY34 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UY34 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UY34 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UY34 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UY34 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UY34 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UY34 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UY34 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UY34 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms