Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms