Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3UPC7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3UPC7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms