Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms