Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms