Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms