Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms