Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms