Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Nkx6-3Q3UHX8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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