Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms