Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms