Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms