Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms