Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Gtpbp6Q3U6U5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Gtpbp6Q3U6U5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Gtpbp6Q3U6U5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Gtpbp6Q3U6U5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Gtpbp6Q3U6U5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms