Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VwceQ3U515 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms