Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Otud5Q3U2S4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otud5Q3U2S4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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