Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tatdn3Q3U1C6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tatdn3Q3U1C6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms