Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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