Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700066B19RikQ3TS39 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms