Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms