Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp39Q3TIX9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms