Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RubcnlQ3TD16 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RubcnlQ3TD16 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms