Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms