Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms