Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vax1Q2NKI2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms