Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp1aQ2LKU9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms