Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
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Shroom4Q1W617 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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Shroom4Q1W617 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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Shroom4Q1W617 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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Shroom4Q1W617 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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Shroom4Q1W617 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
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