Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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