Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Perm1Q149B8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms