Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms