Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntnap5cQ0V8T7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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